日本藥房分為藥房與連鎖藥妝店兩大類。 日本的醫藥零售體系大體可分為兩大類：主要承接處方并進行配藥的配藥藥房； 以及以 OTC、日用品、化妝品為主，兼有處方配藥的各種零售藥店。 這兩個市場的規模大體相當，但是增速和集中度差異很大，零售藥店市場總量近年來已經增長緩慢，龍頭集中度迅速提高；而配藥藥房仍有 10%左右增速，而且呈現非常分散的競爭格局。 從商品構成來看， 醫藥品已經從過去的 60%下降到現在 30%，化妝品占 21%，日用雜品占22%，體現了從疾病產業到健康產業的路線轉移。

2016 年日本連鎖藥店銷售類別構成

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　　日本藥店集中度近五年來快速提高，前 10 強集中度達到約 67%，龍頭企業增速超過行業。 日本零售藥房在醫藥分開后的 21 世紀初增長迅速（2001-2003CARG 13%），但 2013-15 年連續三年市場規模增速僅為 1%左右，陷入停滯。2016 年首次恢復到 6.5%，主要是處方藥配藥部門有 9%的增長， 及加強食品部門的經營以及消費者有目的性來店率提高伴隨的一店式購物效果等原因。 其中Top10 的增速超過行業，達到 7.7%。而零售藥店前 10 強的占有率已經從 2010年的 44.5%提高到了 2015 年的 69.5%， 進入寡頭壟斷時期， 2016 年為 67%。藥店市場消費品屬性較強，價格低、品種全是競爭最重要的衡量標準，這點和中國的零售連鎖藥房比較類似。 在市場整體增長緩慢時， 日本龍頭企業的規模和品牌優勢體現出馬太效應， 甚至加速了行業集中度的提升。 而支持連鎖藥店增長的動力有一店式購物、 醫療機構開出的處方單需求，配藥室并設的店鋪增加等。

2000-2016 日本零售藥房數量和銷售規模變化

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2016 年日本零售藥房 Top10 收入和增長情況

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　　配藥藥局連鎖企業的排行前 5 位如下表， 第 1 名 AINE PHARMACY 是可以進入連鎖藥店前十強排名的， 可以排到第 9 位。 配藥連鎖企業增速（9%）普遍高于行業， 今后配藥部分應該會成為連鎖藥店的核心業務， 會成為具有一站式購物功能店鋪的集客武器。

2016 日本連鎖配藥藥局收入排行前 5 名

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　　日本的醫藥分離改革對當前中國醫改藥品零加成政策推動的處方外流有啟示作用。 除了傳統的提高醫師診療報酬和壓縮藥品進銷差價之外，日本仿制藥的一致性評價也為處方外流提供了助力。 日本也曾經歷過漫長的醫藥分離過程。1998 年，日本開始“藥品品質再評價工程”， 之后厚生勞動省設立鼓勵公立醫院處方外發的政策，醫藥分業率（指的是被指定為保險定點單位的院外藥房的“處方接受率”，而“處方接受率”指的是在醫院和診所的門診患者中，在院外藥房接受藥品的處方數占開藥的總處方數的比率）從 30.5%迅速提升到 2014 年的近 68.7%， 并且前幾年 1998- 2001 年為兩位數快速增長期。而日本連鎖藥店的銷售額 2001-2003 經歷了比較快速的成長。 現在日本的醫藥零售業有 8.5 萬家門店，其中登記為保險藥房，可以憑處方配藥的有 5.7 萬家門店。藥品零加成使得醫院藥房成為成本中心而不是利潤中心，客觀上會推動藥房托管、處方外流。但是市場對處方外流的推動速度存在爭議。 如果中國醫改真正實現醫藥分離， 具有院邊店、 基層社區門店優勢， 承接處方外流的醫藥零售企業也有望獲得快速增長。